# ========= [INFO] ==========
# Mut inCB: not accepter mutation in BC
# Mut inMS: 2
# InputBAM: 10-N3-12cycles-IDT.AC15.merged.withUMI.group.identity.bam
# seq_deb : GTATGTG
# seq_fin : TATGG
# MS_seq : AC
# excl : G,T
# nom  : AC15
# typeF: IDT
# log file: 10-N3-12cycles-IDT.AC15.merged.withUMI.group.identity.AC15.seq.log
# =============================
#
#-------------- Filt ------------------
# condiGrep: GTAT.TGAC.+ACACAC.+AC.ATGG|GTAT.TGAC.+ACACAC.+ACT.TGG|GTAT.TGAC.+ACACAC.+ACTA.GG|GTAT.TGAC.+ACACAC.+ACTAT.G|GTAT.TGAC.+ACACAC.+ACTATG.|GTATG.GAC.+ACACAC.+AC.ATGG|GTATG.GAC.+ACACAC.+ACT.TGG|GTATG.GAC.+ACACAC.+ACTA.GG|GTATG.GAC.+ACACAC.+ACTAT.G|GTATG.GAC.+ACACAC.+ACTATG.|GTATGT.AC.+ACACAC.+AC.ATGG|GTATGT.AC.+ACACAC.+ACT.TGG|GTATGT.AC.+ACACAC.+ACTA.GG|GTATGT.AC.+ACACAC.+ACTAT.G|GTATGT.AC.+ACACAC.+ACTATG.
# condiSet1: s/\t.*GTAT.TGAC/\tAC/;s/\t.*GTATG.GAC/\tAC/;s/\t.*GTATGT.AC/\tAC/
# condiSet2: s/AC.ATGG.*$/AC/;s/ACT.TGG.*$/AC/;s/ACTA.GG.*$/AC/;s/ACTAT.G.*$/AC/;s/ACTATG..*$/AC/
#--------------------------------------
